MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. KH32C plasmid pAZKH DNA

Total Repeats: 1592

< Previous1234Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020548	CCGA	2	8	673075	673082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_020548	CTGG	2	8	673139	673146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_020548	AAG	2	6	673167	673172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020548	ATG	2	6	673198	673203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020548	TGC	2	6	673292	673297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020548	GAG	2	6	673327	673332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020548	TTA	2	6	675788	675793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020548	AGA	2	6	675800	675805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020548	GGAT	2	8	675923	675930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020548	AGC	2	6	675939	675944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_020548	TC	3	6	678175	678180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_020548	ATT	2	6	678184	678189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020548	TC	3	6	678223	678228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_020548	AC	3	6	680281	680286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_020548	GCA	2	6	681070	681075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_020548	ACG	2	6	681974	681979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_020548	AGG	2	6	681991	681996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020548	C	6	6	684927	684932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1519	NC_020548	GCC	2	6	684952	684957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_020548	GA	3	6	686985	686990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020548	TTC	2	6	687967	687972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_020548	GACG	2	8	687974	687981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_020548	CAA	2	6	688577	688582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_020548	CGCATG	2	12	688596	688607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_020548	TCC	2	6	689633	689638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_020548	T	6	6	689671	689676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020548	CGC	2	6	689702	689707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_020548	GGT	2	6	689729	689734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020548	CCG	2	6	689788	689793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_020548	GGC	2	6	691248	691253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_020548	CTG	2	6	691269	691274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_020548	TG	3	6	691280	691285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020548	G	6	6	691293	691298	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020548	CG	3	6	691322	691327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_020548	GCT	2	6	691328	691333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_020548	GTGA	2	8	695286	695293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020548	CCGG	2	8	695376	695383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_020548	ACG	2	6	695435	695440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_020548	TCGG	2	8	695478	695485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_020548	AG	3	6	695487	695492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020548	CGG	2	6	695528	695533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_020548	TTC	2	6	695559	695564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_020548	CCCT	2	8	695625	695632	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1544	NC_020548	ACC	2	6	695689	695694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_020548	GGC	2	6	696149	696154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_020548	GCC	2	6	696158	696163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_020548	C	6	6	696634	696639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1548	NC_020548	GGC	2	6	696696	696701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020548	AGC	2	6	700732	700737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_020548	CGG	2	6	700789	700794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_020548	GCGT	2	8	700820	700827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_020548	ACA	2	6	701986	701991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_020548	CTTC	2	8	703343	703350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_020548	GT	3	6	704838	704843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020548	TCAA	2	8	704892	704899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_020548	A	7	7	704905	704911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020548	TCGC	2	8	704915	704922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_020548	GAT	2	6	704965	704970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020548	CGG	2	6	704977	704982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_020548	CGAG	2	8	705129	705136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_020548	GCG	2	6	705156	705161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_020548	GGA	2	6	705163	705168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020548	A	7	7	705257	705263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020548	GCC	2	6	705264	705269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_020548	TGG	2	6	705279	705284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020548	GGA	2	6	705316	705321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020548	ACG	2	6	712980	712985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_020548	TAC	2	6	714352	714357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_020548	TTCCGT	2	12	714360	714371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_020548	GCC	2	6	714407	714412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_020548	GTTC	2	8	721161	721168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_020548	GGA	2	6	722148	722153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020548	TC	3	6	725662	725667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_020548	CGC	2	6	725749	725754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_020548	GCG	2	6	725783	725788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_020548	ACCG	2	8	725790	725797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_020548	CCCTG	2	10	729286	729295	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1578	NC_020548	CCT	2	6	729297	729302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_020548	TGG	2	6	729312	729317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020548	TGC	2	6	729410	729415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_020548	TGC	2	6	729431	729436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_020548	GCA	2	6	729458	729463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_020548	GC	3	6	729501	729506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_020548	TGG	2	6	729542	729547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020548	GCG	2	6	729576	729581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_020548	GCT	2	6	729587	729592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_020548	CG	3	6	729662	729667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_020548	AGC	2	6	729673	729678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_020548	CGAT	2	8	729717	729724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_020548	GGA	2	6	730381	730386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020548	CGG	2	6	730390	730395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_020548	TTG	2	6	734299	734304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous1234Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.